Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGISQ16647 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGISQ16647 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGISQ16647 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms