Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK4Q16099 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK4Q16099 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK4Q16099 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK4Q16099 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK4Q16099 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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