Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIP4Q15650 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP4Q15650 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP4Q15650 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP4Q15650 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP4Q15650 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP4Q15650 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIP4Q15650 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIP4Q15650 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIP4Q15650 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms