Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD3Q15059 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD3Q15059 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD3Q15059 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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