Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAM2Q15035 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAM2Q15035 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAM2Q15035 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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