Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD9Q14511 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD9Q14511 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEDD9Q14511 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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