Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CKAP5Q14008 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP5Q14008 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP5Q14008 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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