Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALCAMQ13740 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALCAMQ13740 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ALCAMQ13740 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
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