Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A4Q13733 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP1A4Q13733 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A4Q13733 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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