Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNASE1L3Q13609 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNASE1L3Q13609 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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