Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLF1Q13351 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF1Q13351 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF1Q13351 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF1Q13351 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms