Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAF2Q12933 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF2Q12933 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF2Q12933 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms