Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.064e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-210ENST00000527387 579 ntTSL 414.79□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)14.75□□□□□ -0.051e-11■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 314.18□□□□□ -0.141e-11■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-206ENST00000525624 1048 ntTSL 514.04□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-217ENST00000532182 674 ntTSL 411.77□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 210.02□□□□□ -0.811e-11■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 49.31□□□□□ -0.921e-11■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 36.62□□□□□ -1.353e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-212ENST00000528292 1112 ntTSL 26.44□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-216ENST00000532167 570 ntTSL 45.31□□□□□ -1.563e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.613e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-205ENST00000525463 583 ntTSL 53.75□□□□□ -1.813e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-204ENST00000524590 536 ntTSL 53.17□□□□□ -1.93e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-214ENST00000531063 578 ntTSL 22.9□□□□□ -1.953e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.94e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.84e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 226.22■■□□□ 1.794e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.684e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.564e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-211ENST00000494498 840 ntTSL 320.48■□□□□ 0.874e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 320.48■□□□□ 0.874e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 FTCD-206ENST00000460011 1260 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.844e-7■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.676e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.456e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 XYLT2-206ENST00000571021 2174 nt13.22□□□□□ -0.296e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 XYLT2-202ENST00000376550 3267 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.46e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.576e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.446e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.446e-6■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-7■■■■□ 21.3
GRSF1Q12849 G3BP1-212ENST00000522761 1763 ntTSL 217.47■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 G3BP1-208ENST00000520177 2700 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 G3BP1-201ENST00000356245 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.513e-6■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.298e-8■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.453e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.963e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-206ENST00000420497 514 ntTSL 520.82■□□□□ 0.923e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-208ENST00000440779 805 ntTSL 320.82■□□□□ 0.923e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.643e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-203ENST00000406979 2352 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.453e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 SPAG16-211ENST00000452556 4751 ntTSL 28.35□□□□□ -1.073e-9■■■■□ 21.2
GRSF1Q12849 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 01e-7■■■■□ 21.1
GRSF1Q12849 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 214.79□□□□□ -0.045e-6■■■■□ 21
GRSF1Q12849 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 20.8
GRSF1Q12849 KEAP1-210ENST00000592478 1044 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 20.8
GRSF1Q12849 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 20.8
GRSF1Q12849 PTOV1-205ENST00000595934 1880 nt22.97■■□□□ 1.272e-16■■■■□ 20.8
GRSF1Q12849 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt29■■■□□ 2.231e-10■■■■□ 20.8
GRSF1Q12849 H3F3B-213ENST00000593254 894 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-10■■■■□ 20.8
GRSF1Q12849 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-10■■■■□ 20.8
GRSF1Q12849 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.993e-6■■■■□ 20.7
GRSF1Q12849 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)24.87■■□□□ 1.572e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.362e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)22.5■■□□□ 1.192e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 222.5■■□□□ 1.192e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-7■■■■□ 20.6
GRSF1Q12849 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.786e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-219ENST00000497256 458 ntTSL 225.02■■□□□ 1.66e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 AL121845.3-203ENST00000496820 507 ntTSL 524.74■■□□□ 1.556e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-211ENST00000443532 968 ntTSL 524.24■■□□□ 1.476e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 LIME1-203ENST00000465591 680 ntTSL 223.01■■□□□ 1.276e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-204ENST00000413463 542 ntTSL 521.78■■□□□ 1.086e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-212ENST00000446202 548 ntTSL 421.78■■□□□ 1.086e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.966e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.926e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 LIME1-210ENST00000621325 2410 ntTSL 220.25■□□□□ 0.836e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 419.94■□□□□ 0.786e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-217ENST00000508299 592 ntTSL 219.74■□□□□ 0.756e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 219.18■□□□□ 0.666e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.656e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 CNTROB-204ENST00000570782 752 ntTSL 218.02■□□□□ 0.486e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.456e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.416e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 LIME1-202ENST00000444951 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.57■□□□□ 0.46e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.44e-11■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-203ENST00000412508 585 ntTSL 217.38■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 317.09■□□□□ 0.336e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 ARHGEF39-206ENST00000490970 1270 ntTSL 517.04■□□□□ 0.326e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.34e-11■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.296e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-11■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.216e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 AHSA1-213ENST00000557476 584 ntTSL 316.22■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 AHSA1-209ENST00000555729 621 ntTSL 316.22■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 20.5
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