Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPTFQ12830 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPTFQ12830 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPTFQ12830 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms