Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWF1Q12792 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWF1Q12792 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWF1Q12792 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWF1Q12792 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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