Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 GND1YHR183W 1470 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YJR096WYJR096W 849 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YPS3YLR121C 1527 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 SEC61YLR378C 1443 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YNL226WYNL226W 411 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 TIF5YPR041W 1218 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YCR025CYCR025C 411 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 CSM1YCR086W 573 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 RBG2YGR173W 1107 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YET2YMR040W 483 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 QDR2YIL121W 1629 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 VPS62YGR141W 1404 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 SLI1YGR212W 1407 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 RFC1YOR217W 2586 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 SRL2YLR082C 1179 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 SRT1YMR101C 1032 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YIP3YNL044W 531 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 PHO23YNL097C 993 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YBR089WYBR089W 600 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 MSC1YML128C 1542 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 NMT1YLR195C 1368 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 HMG2YLR450W 3138 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 LOT5YKL183W 921 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 PTC4YBR125C 1182 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YBR134WYBR134W 402 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 SAS4YDR181C 1446 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YDL086WYDL086W 822 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 MMS2YGL087C 414 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 CTR3YLR411W 726 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 PSD1YNL169C 1503 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 IPI3YNL182C 1668 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 DIG1YPL049C 1359 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 ATG22YCL038C 1587 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 FUB1YCR076C 753 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 HEM13YDR044W 987 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 SUI2YJR007W 915 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 ISY1YJR050W 708 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YMR187CYMR187C 1296 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 SSU72YNL222W 621 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YOL024WYOL024W 519 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 MRPL23YOR150W 492 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YER188WYER188W 720 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 YFR057WYFR057W 456 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 DCD1YHR144C 939 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 AIM23YJL131C 1071 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 MTR2YKL186C 555 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 MTG1YMR097C 1104 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 GLC8YMR311C 690 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 SAM3YPL274W 1764 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 DMA2YNL116W 1569 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 BSP1YPR171W 1731 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-BLQ12266 MRPL32YCR003W 552 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 UFD1YGR048W 1086 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 LST7YGR057C 729 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 DID2YKR035W-A 615 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YNR048WYNR048W 1182 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 GID8YMR135C 1368 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 RAM1YDL090C 1296 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 CSM3YMR048W 954 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 CYT1YOR065W 930 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 HEM15YOR176W 1182 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 ODC1YPL134C 933 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 TPO4YOR273C 1980 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 snR57snR57 88 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YDL119CYDL119C 924 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 MRP1YDR347W 966 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 MSP1YGR028W 1089 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 ILV2YMR108W 2064 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 CMK1YFR014C 1341 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YGR066CYGR066C 879 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YJL055WYJL055W 738 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YLR366WYLR366W 306 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 TLG2YOL018C 1194 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 ATG19YOL082W 1248 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YPR177CYPR177C 372 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 MRS6YOR370C 1812 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YDL241WYDL241W 372 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 GTB1YDR221W 2109 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YOL106WYOL106W 354 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 HXT12YIL170W 1374 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 CLP1YOR250C 1338 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 YHL008CYHL008C 1884 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 IRC9YJL142C 393 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 LEU2YCL018W 1095 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 SSL2YIL143C 2532 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-BLQ12266 TAT2YOL020W 1779 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 YBR138CYBR138C 1575 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 PEX7YDR142C 1128 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 HVG1YER039C 750 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 SPO16YHR153C 597 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 NUC1YJL208C 990 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 DML1YMR211W 1428 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 MDM10YAL010C 1482 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 DTR1YBR180W 1719 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 YKL133CYKL133C 1392 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-BLQ12266 YDL129WYDL129W 876 nt8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms