Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF415Q09FC8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF415Q09FC8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF415Q09FC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF415Q09FC8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF415Q09FC8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms