Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF4Q08170 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF4Q08170 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF4Q08170 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF4Q08170 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF4Q08170 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF4Q08170 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF4Q08170 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF4Q08170 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF4Q08170 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF4Q08170 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF4Q08170 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF4Q08170 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF4Q08170 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF4Q08170 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF4Q08170 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF4Q08170 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF4Q08170 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF4Q08170 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF4Q08170 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF4Q08170 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF4Q08170 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF4Q08170 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF4Q08170 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF4Q08170 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF4Q08170 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF4Q08170 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF4Q08170 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms