Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX8Q06710 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX8Q06710 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms