Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RING1Q06587 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RING1Q06587 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RING1Q06587 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RING1Q06587 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RING1Q06587 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RING1Q06587 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RING1Q06587 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RING1Q06587 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RING1Q06587 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RING1Q06587 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RING1Q06587 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RING1Q06587 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RING1Q06587 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RING1Q06587 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RING1Q06587 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RING1Q06587 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RING1Q06587 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RING1Q06587 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RING1Q06587 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RING1Q06587 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RING1Q06587 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RING1Q06587 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RING1Q06587 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RING1Q06587 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RING1Q06587 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RING1Q06587 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RING1Q06587 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RING1Q06587 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RING1Q06587 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RING1Q06587 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RING1Q06587 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RING1Q06587 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RING1Q06587 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RING1Q06587 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RING1Q06587 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RING1Q06587 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RING1Q06587 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RING1Q06587 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RING1Q06587 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RING1Q06587 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RING1Q06587 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RING1Q06587 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RING1Q06587 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RING1Q06587 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RING1Q06587 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RING1Q06587 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RING1Q06587 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RING1Q06587 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RING1Q06587 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RING1Q06587 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RING1Q06587 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RING1Q06587 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RING1Q06587 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RING1Q06587 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RING1Q06587 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RING1Q06587 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RING1Q06587 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RING1Q06587 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RING1Q06587 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RING1Q06587 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RING1Q06587 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RING1Q06587 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RING1Q06587 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RING1Q06587 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RING1Q06587 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RING1Q06587 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RING1Q06587 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RING1Q06587 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RING1Q06587 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RING1Q06587 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RING1Q06587 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RING1Q06587 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RING1Q06587 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RING1Q06587 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RING1Q06587 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RING1Q06587 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RING1Q06587 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RING1Q06587 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RING1Q06587 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RING1Q06587 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RING1Q06587 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RING1Q06587 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RING1Q06587 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RING1Q06587 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RING1Q06587 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RING1Q06587 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RING1Q06587 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms