Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BDH1Q02338 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BDH1Q02338 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BDH1Q02338 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms