Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPEQ02224 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPEQ02224 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms