Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 NAP1YKR048C 1254 nt7.16□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 RHO1YPR165W 630 nt7.16□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 YKR018CYKR018C 2178 nt7.16□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 SHC1YER096W 1539 nt7.16□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.16□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 ERO1YML130C 1692 nt7.16□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 ADE2YOR128C 1716 nt7.15□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 MAL31YBR298C 1845 nt7.15□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 GNA1YFL017C 480 nt7.14□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 OCH1YGL038C 1443 nt7.14□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 ECM10YEL030W 1935 nt7.13□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.13□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 SER2YGR208W 930 nt7.13□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 YBL113CYBL113C 2379 nt7.12□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 THI73YLR004C 1572 nt7.12□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 RPL12BYDR418W 498 nt7.12□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 RCF2YNR018W 675 nt7.12□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 YER137CYER137C 447 nt7.11□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 YOR041CYOR041C 432 nt7.11□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 CTF3YLR381W 2202 nt7.11□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 LEO1YOR123C 1395 nt7.1□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 HTS1YPR033C 1641 nt7.1□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 ATO2YNR002C 849 nt7.1□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 PUS7YOR243C 2031 nt7.1□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 PRB1YEL060C 1908 nt7.09□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 SEC24YIL109C 2781 nt7.09□□□□□ -1.27
NUP49Q02199 YGR210CYGR210C 1236 nt7.08□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 PUP1YOR157C 786 nt7.08□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 AOS1YPR180W 1044 nt7.08□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 CAK1YFL029C 1107 nt7.07□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 HAM1YJR069C 594 nt7.07□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 YMR166CYMR166C 1107 nt7.07□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 DCR2YLR361C 1737 nt7.07□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 CDC23YHR166C 1881 nt7.07□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 BNA3YJL060W 1335 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 VPS65YLR322W 315 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 TOD6YBL054W 1578 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 MAM3YOL060C 2121 nt7.06□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 TCB1YOR086C 3561 nt7.05□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 SWM1YDR260C 513 nt7.05□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 YJL043WYJL043W 774 nt7.05□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 YPL108WYPL108W 507 nt7.05□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 NDE1YMR145C 1683 nt7.05□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 RMD8YFR048W 1989 nt7.04□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 GTS1YGL181W 1191 nt7.04□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 SNF7YLR025W 723 nt7.04□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 AFG2YLR397C 2343 nt7.04□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 TIM50YPL063W 1431 nt7.03□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 DST1YGL043W 930 nt7.03□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 PRE10YOR362C 867 nt7.03□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 HNM1YGL077C 1692 nt7.03□□□□□ -1.28
NUP49Q02199 MAS2YHR024C 1449 nt7.02□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 TPI1YDR050C 747 nt7.02□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 PET10YKR046C 852 nt7.02□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 FLC2YAL053W 2352 nt7.01□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 YCP4YCR004C 744 nt7.01□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 SLG1YOR008C 1137 nt7.01□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 ARG7YMR062C 1326 nt7.01□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 YPT31YER031C 672 nt7□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 YHR033WYHR033W 1272 nt7□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 RRT14YIL127C 621 nt7□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 LSP1YPL004C 1026 nt7□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 MNN9YPL050C 1188 nt7□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 CKI1YLR133W 1749 nt6.99□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 CAN1YEL063C 1773 nt6.98□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 YIL108WYIL108W 2091 nt6.98□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 YDR215CYDR215C 414 nt6.98□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 ERV25YML012W 636 nt6.98□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 FCY1YPR062W 477 nt6.98□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 MSS51YLR203C 1311 nt6.98□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 JHD1YER051W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 CAR2YLR438W 1275 nt6.97□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.97□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 RTC2YBR147W 891 nt6.97□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 ENB1YOL158C 1821 nt6.97□□□□□ -1.29
NUP49Q02199 YNL040WYNL040W 1371 nt6.95□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 CPR2YHR057C 618 nt6.95□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 PET18YCR020C 648 nt6.94□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YJL160CYJL160C 864 nt6.94□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 PMU1YKL128C 888 nt6.94□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 RFS1YBR052C 633 nt6.94□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 CCR4YAL021C 2514 nt6.93□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YMR007WYMR007W 381 nt6.93□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YEL023CYEL023C 2049 nt6.93□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YER156CYER156C 1017 nt6.92□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YGL260WYGL260W 231 nt6.92□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 BXI1YNL305C 894 nt6.92□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YBL111CYBL111C 2004 nt6.92□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 HRA1HRA1 564 nt6.91□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YPC1YBR183W 951 nt6.91□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 PRY2YKR013W 990 nt6.9□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 APT1YML022W 564 nt6.9□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 RPS6AYPL090C 711 nt6.9□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 YAH1YPL252C 519 nt6.9□□□□□ -1.3
NUP49Q02199 RPS6BYBR181C 711 nt6.9□□□□□ -1.3
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