Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROR1Q01973 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROR1Q01973 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROR1Q01973 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms