Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC6A3Q01959 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC6A3Q01959 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC6A3Q01959 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC6A3Q01959 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC6A3Q01959 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms