Protein–RNA interactions for Protein: Q01590

SED5, Integral membrane protein SED5, yeastyeast

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED5Q01590 AQR1YNL065W 1761 nt7.54□□□□□ -1.2
SED5Q01590 YIR035CYIR035C 765 nt7.54□□□□□ -1.2
SED5Q01590 ATO2YNR002C 849 nt7.54□□□□□ -1.2
SED5Q01590 ADA2YDR448W 1305 nt7.53□□□□□ -1.2
SED5Q01590 RSC9YML127W 1746 nt7.53□□□□□ -1.2
SED5Q01590 DIP5YPL265W 1827 nt7.53□□□□□ -1.2
SED5Q01590 PDC6YGR087C 1692 nt7.53□□□□□ -1.2
SED5Q01590 POB3YML069W 1659 nt7.52□□□□□ -1.21
SED5Q01590 TDA4YJR116W 840 nt7.52□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YLR030WYLR030W 792 nt7.52□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YPR084WYPR084W 1371 nt7.51□□□□□ -1.21
SED5Q01590 UTR5YEL035C 501 nt7.51□□□□□ -1.21
SED5Q01590 RNA170RNA170 169 nt7.5□□□□□ -1.21
SED5Q01590 MRP7YNL005C 1116 nt7.5□□□□□ -1.21
SED5Q01590 TAD2YJL035C 753 nt7.49□□□□□ -1.21
SED5Q01590 AFG2YLR397C 2343 nt7.49□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YPT31YER031C 672 nt7.48□□□□□ -1.21
SED5Q01590 BXI1YNL305C 894 nt7.48□□□□□ -1.21
SED5Q01590 RPS6AYPL090C 711 nt7.48□□□□□ -1.21
SED5Q01590 RPS6BYBR181C 711 nt7.48□□□□□ -1.21
SED5Q01590 TPO1YLL028W 1761 nt7.48□□□□□ -1.21
SED5Q01590 PDC5YLR134W 1692 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YKR018CYKR018C 2178 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 ARO3YDR035W 1113 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YER137CYER137C 447 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YMR206WYMR206W 942 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 NDE1YMR145C 1683 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.47□□□□□ -1.21
SED5Q01590 EHT1YBR177C 1356 nt7.46□□□□□ -1.21
SED5Q01590 MAS2YHR024C 1449 nt7.46□□□□□ -1.21
SED5Q01590 YOR268CYOR268C 399 nt7.46□□□□□ -1.22
SED5Q01590 AVL9YLR114C 2295 nt7.46□□□□□ -1.22
SED5Q01590 ELP4YPL101W 1371 nt7.46□□□□□ -1.22
SED5Q01590 YDR306CYDR306C 1437 nt7.45□□□□□ -1.22
SED5Q01590 CKB1YGL019W 837 nt7.45□□□□□ -1.22
SED5Q01590 ELP6YMR312W 822 nt7.45□□□□□ -1.22
SED5Q01590 YIL108WYIL108W 2091 nt7.44□□□□□ -1.22
SED5Q01590 ATP2YJR121W 1536 nt7.44□□□□□ -1.22
SED5Q01590 EDC2YER035W 438 nt7.44□□□□□ -1.22
SED5Q01590 ALG7YBR243C 1347 nt7.44□□□□□ -1.22
SED5Q01590 PEX28YHR150W 1740 nt7.44□□□□□ -1.22
SED5Q01590 TDH1YJL052W 999 nt7.43□□□□□ -1.22
SED5Q01590 SNA3YJL151C 402 nt7.43□□□□□ -1.22
SED5Q01590 RHO1YPR165W 630 nt7.43□□□□□ -1.22
SED5Q01590 BNA3YJL060W 1335 nt7.43□□□□□ -1.22
SED5Q01590 GNP1YDR508C 1992 nt7.42□□□□□ -1.22
SED5Q01590 RUP1YOR138C 2016 nt7.42□□□□□ -1.22
SED5Q01590 MTC6YHR151C 1581 nt7.42□□□□□ -1.22
SED5Q01590 MAL31YBR298C 1845 nt7.41□□□□□ -1.22
SED5Q01590 ADE1YAR015W 921 nt7.4□□□□□ -1.22
SED5Q01590 PRB1YEL060C 1908 nt7.4□□□□□ -1.23
SED5Q01590 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.39□□□□□ -1.23
SED5Q01590 THI73YLR004C 1572 nt7.39□□□□□ -1.23
SED5Q01590 YNL040WYNL040W 1371 nt7.39□□□□□ -1.23
SED5Q01590 TOS1YBR162C 1368 nt7.39□□□□□ -1.23
SED5Q01590 PUP3YER094C 618 nt7.38□□□□□ -1.23
SED5Q01590 KAE1YKR038C 1161 nt7.38□□□□□ -1.23
SED5Q01590 YOR041CYOR041C 432 nt7.38□□□□□ -1.23
SED5Q01590 WSC3YOL105C 1671 nt7.38□□□□□ -1.23
SED5Q01590 SEC24YIL109C 2781 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 NUP53YMR153W 1428 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 RMD8YFR048W 1989 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 YBL113CYBL113C 2379 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 GNA1YFL017C 480 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 YJL043WYJL043W 774 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 PMU1YKL128C 888 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 FUS3YBL016W 1062 nt7.37□□□□□ -1.23
SED5Q01590 TES1YJR019C 1050 nt7.36□□□□□ -1.23
SED5Q01590 RCF1YML030W 480 nt7.36□□□□□ -1.23
SED5Q01590 FRA1YLL029W 2250 nt7.35□□□□□ -1.23
SED5Q01590 YIL168WYIL168W 384 nt7.35□□□□□ -1.23
SED5Q01590 CDA1YLR307W 906 nt7.35□□□□□ -1.23
SED5Q01590 TOD6YBL054W 1578 nt7.34□□□□□ -1.23
SED5Q01590 PUS7YOR243C 2031 nt7.34□□□□□ -1.23
SED5Q01590 SHC1YER096W 1539 nt7.34□□□□□ -1.23
SED5Q01590 YGR137WYGR137W 375 nt7.34□□□□□ -1.23
SED5Q01590 PRE10YOR362C 867 nt7.34□□□□□ -1.23
SED5Q01590 ECM10YEL030W 1935 nt7.34□□□□□ -1.23
SED5Q01590 MFG1YDL233W 1377 nt7.33□□□□□ -1.24
SED5Q01590 YBL111CYBL111C 2004 nt7.33□□□□□ -1.24
SED5Q01590 TIM50YPL063W 1431 nt7.33□□□□□ -1.24
SED5Q01590 PET494YNR045W 1470 nt7.32□□□□□ -1.24
SED5Q01590 SNP1YIL061C 903 nt7.32□□□□□ -1.24
SED5Q01590 NSG2YNL156C 900 nt7.32□□□□□ -1.24
SED5Q01590 LEO1YOR123C 1395 nt7.32□□□□□ -1.24
SED5Q01590 JHD1YER051W 1479 nt7.31□□□□□ -1.24
SED5Q01590 RCF2YNR018W 675 nt7.31□□□□□ -1.24
SED5Q01590 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.3□□□□□ -1.24
SED5Q01590 HXT13YEL069C 1695 nt7.3□□□□□ -1.24
SED5Q01590 RTG2YGL252C 1767 nt7.3□□□□□ -1.24
SED5Q01590 CDC23YHR166C 1881 nt7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms