Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP2P81877 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP2P81877 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP2P81877 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms