Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA4AP68366 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA4AP68366 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms