Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPD1P62314 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPD1P62314 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPD1P62314 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms