Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS3AP61247 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS3AP61247 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms