Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTENP60484 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTENP60484 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTENP60484 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTENP60484 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTENP60484 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTENP60484 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTENP60484 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTENP60484 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTENP60484 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTENP60484 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTENP60484 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTENP60484 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTENP60484 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTENP60484 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTENP60484 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTENP60484 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTENP60484 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTENP60484 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTENP60484 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTENP60484 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTENP60484 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTENP60484 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTENP60484 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTENP60484 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTENP60484 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTENP60484 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTENP60484 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTENP60484 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTENP60484 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTENP60484 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTENP60484 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTENP60484 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTENP60484 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTENP60484 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTENP60484 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTENP60484 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTENP60484 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTENP60484 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTENP60484 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTENP60484 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTENP60484 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTENP60484 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTENP60484 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTENP60484 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTENP60484 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTENP60484 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTENP60484 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTENP60484 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTENP60484 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTENP60484 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTENP60484 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTENP60484 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTENP60484 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTENP60484 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTENP60484 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTENP60484 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTENP60484 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTENP60484 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTENP60484 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTENP60484 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTENP60484 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTENP60484 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTENP60484 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTENP60484 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTENP60484 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTENP60484 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTENP60484 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTENP60484 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTENP60484 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTENP60484 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTENP60484 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTENP60484 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTENP60484 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTENP60484 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTENP60484 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTENP60484 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTENP60484 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms