Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00315P59091 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00315P59091 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms