Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS3P57727 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS3P57727 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS3P57727 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms