Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIPK4P57078 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIPK4P57078 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIPK4P57078 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIPK4P57078 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RIPK4P57078 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 419.7 ms