Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHB4P54760 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHB4P54760 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB4P54760 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPHB4P54760 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms