Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2KP53803 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2KP53803 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms