Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LUMP51884 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LUMP51884 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LUMP51884 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LUMP51884 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LUMP51884 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LUMP51884 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LUMP51884 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LUMP51884 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LUMP51884 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LUMP51884 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LUMP51884 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LUMP51884 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LUMP51884 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LUMP51884 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LUMP51884 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LUMP51884 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LUMP51884 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LUMP51884 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LUMP51884 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LUMP51884 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LUMP51884 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LUMP51884 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LUMP51884 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LUMP51884 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LUMP51884 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LUMP51884 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LUMP51884 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LUMP51884 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LUMP51884 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LUMP51884 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LUMP51884 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LUMP51884 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LUMP51884 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LUMP51884 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LUMP51884 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LUMP51884 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LUMP51884 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LUMP51884 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LUMP51884 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LUMP51884 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LUMP51884 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LUMP51884 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LUMP51884 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LUMP51884 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LUMP51884 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LUMP51884 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LUMP51884 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LUMP51884 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LUMP51884 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LUMP51884 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LUMP51884 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LUMP51884 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LUMP51884 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LUMP51884 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LUMP51884 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LUMP51884 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LUMP51884 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LUMP51884 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LUMP51884 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LUMP51884 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LUMP51884 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LUMP51884 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LUMP51884 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms