Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCT4P50991 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCT4P50991 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCT4P50991 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCT4P50991 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCT4P50991 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCT4P50991 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCT4P50991 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCT4P50991 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCT4P50991 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCT4P50991 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCT4P50991 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCT4P50991 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCT4P50991 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCT4P50991 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCT4P50991 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCT4P50991 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCT4P50991 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCT4P50991 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCT4P50991 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCT4P50991 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCT4P50991 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCT4P50991 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCT4P50991 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCT4P50991 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCT4P50991 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCT4P50991 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCT4P50991 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCT4P50991 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCT4P50991 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCT4P50991 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCT4P50991 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCT4P50991 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCT4P50991 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCT4P50991 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CCT4P50991 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCT4P50991 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCT4P50991 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCT4P50991 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCT4P50991 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CCT4P50991 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCT4P50991 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCT4P50991 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CCT4P50991 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCT4P50991 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCT4P50991 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCT4P50991 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCT4P50991 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCT4P50991 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCT4P50991 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCT4P50991 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCT4P50991 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCT4P50991 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCT4P50991 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCT4P50991 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCT4P50991 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCT4P50991 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCT4P50991 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCT4P50991 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCT4P50991 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCT4P50991 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCT4P50991 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCT4P50991 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCT4P50991 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCT4P50991 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCT4P50991 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCT4P50991 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCT4P50991 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCT4P50991 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCT4P50991 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCT4P50991 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCT4P50991 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCT4P50991 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCT4P50991 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCT4P50991 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCT4P50991 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCT4P50991 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCT4P50991 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCT4P50991 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCT4P50991 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCT4P50991 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCT4P50991 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCT4P50991 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCT4P50991 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCT4P50991 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCT4P50991 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCT4P50991 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCT4P50991 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCT4P50991 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCT4P50991 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCT4P50991 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCT4P50991 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCT4P50991 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms