Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN1CP49918 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN1CP49918 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN1CP49918 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN1CP49918 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN1CP49918 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN1CP49918 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDKN1CP49918 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN1CP49918 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms