Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LIG4P49917 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIG4P49917 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIG4P49917 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIG4P49917 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIG4P49917 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIG4P49917 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIG4P49917 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIG4P49917 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIG4P49917 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LIG4P49917 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LIG4P49917 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LIG4P49917 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIG4P49917 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIG4P49917 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIG4P49917 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIG4P49917 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIG4P49917 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIG4P49917 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIG4P49917 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIG4P49917 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIG4P49917 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIG4P49917 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIG4P49917 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIG4P49917 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIG4P49917 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIG4P49917 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIG4P49917 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIG4P49917 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIG4P49917 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LIG4P49917 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LIG4P49917 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LIG4P49917 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LIG4P49917 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIG4P49917 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIG4P49917 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIG4P49917 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIG4P49917 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIG4P49917 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LIG4P49917 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIG4P49917 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIG4P49917 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIG4P49917 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG4P49917 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG4P49917 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG4P49917 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
LIG4P49917 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG4P49917 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG4P49917 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG4P49917 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG4P49917 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG4P49917 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG4P49917 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG4P49917 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG4P49917 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG4P49917 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG4P49917 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG4P49917 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG4P49917 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG4P49917 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG4P49917 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG4P49917 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIG4P49917 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIG4P49917 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIG4P49917 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIG4P49917 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIG4P49917 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG4P49917 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG4P49917 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG4P49917 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG4P49917 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG4P49917 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG4P49917 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG4P49917 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIG4P49917 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIG4P49917 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LIG4P49917 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LIG4P49917 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIG4P49917 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIG4P49917 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIG4P49917 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIG4P49917 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIG4P49917 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIG4P49917 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIG4P49917 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms