Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC11A2P49281 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC11A2P49281 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC11A2P49281 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC11A2P49281 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms