Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTDSS1P48651 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS1P48651 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTDSS1P48651 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTDSS1P48651 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms