Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PIP4K2AP48426 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PIP4K2AP48426 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PIP4K2AP48426 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PIP4K2AP48426 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PIP4K2AP48426 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms