Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNJ1P48048 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNJ1P48048 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNJ1P48048 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ1P48048 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms