Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRCC3P46736 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRCC3P46736 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRCC3P46736 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BRCC3P46736 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCC3P46736 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRCC3P46736 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRCC3P46736 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCC3P46736 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms