Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA3P42263 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA3P42263 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms