Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTR1BP42025 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR1BP42025 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR1BP42025 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms