Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FEN1P39748 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FEN1P39748 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FEN1P39748 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FEN1P39748 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FEN1P39748 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FEN1P39748 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FEN1P39748 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FEN1P39748 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FEN1P39748 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FEN1P39748 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FEN1P39748 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FEN1P39748 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FEN1P39748 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FEN1P39748 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FEN1P39748 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FEN1P39748 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FEN1P39748 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FEN1P39748 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FEN1P39748 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FEN1P39748 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FEN1P39748 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FEN1P39748 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FEN1P39748 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FEN1P39748 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FEN1P39748 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FEN1P39748 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FEN1P39748 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FEN1P39748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FEN1P39748 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FEN1P39748 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FEN1P39748 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FEN1P39748 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FEN1P39748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FEN1P39748 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FEN1P39748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FEN1P39748 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FEN1P39748 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FEN1P39748 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FEN1P39748 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FEN1P39748 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FEN1P39748 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FEN1P39748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FEN1P39748 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FEN1P39748 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FEN1P39748 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FEN1P39748 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FEN1P39748 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FEN1P39748 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FEN1P39748 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FEN1P39748 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FEN1P39748 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FEN1P39748 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FEN1P39748 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FEN1P39748 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FEN1P39748 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FEN1P39748 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FEN1P39748 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FEN1P39748 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FEN1P39748 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FEN1P39748 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FEN1P39748 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FEN1P39748 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FEN1P39748 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FEN1P39748 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FEN1P39748 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FEN1P39748 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FEN1P39748 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FEN1P39748 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FEN1P39748 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FEN1P39748 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FEN1P39748 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FEN1P39748 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FEN1P39748 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FEN1P39748 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FEN1P39748 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FEN1P39748 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FEN1P39748 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FEN1P39748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FEN1P39748 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FEN1P39748 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FEN1P39748 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms