Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ETFBP38117 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ETFBP38117 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ETFBP38117 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ETFBP38117 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ETFBP38117 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ETFBP38117 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ETFBP38117 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ETFBP38117 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ETFBP38117 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ETFBP38117 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ETFBP38117 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ETFBP38117 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ETFBP38117 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ETFBP38117 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ETFBP38117 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ETFBP38117 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ETFBP38117 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ETFBP38117 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ETFBP38117 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ETFBP38117 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ETFBP38117 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ETFBP38117 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ETFBP38117 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ETFBP38117 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ETFBP38117 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ETFBP38117 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ETFBP38117 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ETFBP38117 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ETFBP38117 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ETFBP38117 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ETFBP38117 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ETFBP38117 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ETFBP38117 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ETFBP38117 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ETFBP38117 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ETFBP38117 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ETFBP38117 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ETFBP38117 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ETFBP38117 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ETFBP38117 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ETFBP38117 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ETFBP38117 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ETFBP38117 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ETFBP38117 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ETFBP38117 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ETFBP38117 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ETFBP38117 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ETFBP38117 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ETFBP38117 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ETFBP38117 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ETFBP38117 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ETFBP38117 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ETFBP38117 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ETFBP38117 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ETFBP38117 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ETFBP38117 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ETFBP38117 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ETFBP38117 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ETFBP38117 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ETFBP38117 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ETFBP38117 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ETFBP38117 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ETFBP38117 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ETFBP38117 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ETFBP38117 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ETFBP38117 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ETFBP38117 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ETFBP38117 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ETFBP38117 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ETFBP38117 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ETFBP38117 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ETFBP38117 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ETFBP38117 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ETFBP38117 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ETFBP38117 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ETFBP38117 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ETFBP38117 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ETFBP38117 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ETFBP38117 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ETFBP38117 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ETFBP38117 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ETFBP38117 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ETFBP38117 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ETFBP38117 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ETFBP38117 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ETFBP38117 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ETFBP38117 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ETFBP38117 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ETFBP38117 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ETFBP38117 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ETFBP38117 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ETFBP38117 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms