Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA7P36544 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA7P36544 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms